一週間、RT-PCRに苦労した。シグナルが出なかったのである。
3つの状況が考えられる。
- 試薬の入れ忘れ
- 試薬の失活
- テンプレートの分解
試薬は入れた。入れ忘れはなかった。
別のサンプルで行ったPCRはバッシと増えた。だからポリメラーゼなどの失活はありえない。
テンプレートの分解か、と思って暗澹とした。
そのセットは、先週の90分おき18時間耐久タイムコースのサンプルだったからである。取り直すとするとまた同じことになる。
ちょっと別のPCRをしようとしてサンプル・試薬を検めていて、気が付いた。
原因（と思われる事柄）を突き止めたのである。
プライマーセットを間違えてしまっていた。
別々の遺伝子用のプライマーを使っていた。ラベルの読み間違いだ。視力の低下がはなはだしい。
もちろん、テンプレートが分解している可能性を拭い去るものではない。
